Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms