Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms