Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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