Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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HOXD8P13378 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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HOXD8P13378 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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