Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF5Q9Y2D1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms