Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCLQ9NW38 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms