Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms