Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DCHS1Q96JQ0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms