Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSMEM1Q8WWF3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms