Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTU1Q7Z7A3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU1Q7Z7A3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms