Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMIM5Q71RC9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM5Q71RC9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms