Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms