Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCTP1Q6DN14 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms