Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF38BQ5VTL8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms