Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms