Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms