Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FXNQ16595 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FXNQ16595 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FXNQ16595 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FXNQ16595 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FXNQ16595 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FXNQ16595 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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