Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN1Q04323 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN1Q04323 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN1Q04323 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN1Q04323 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN1Q04323 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN1Q04323 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms