Protein–RNA interactions for Protein: Q01955

COL4A3, Collagen alpha-3(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3Q01955 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A3Q01955 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms