Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms