Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AIF1P55008 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AIF1P55008 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AIF1P55008 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AIF1P55008 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AIF1P55008 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms