Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLD1P28340 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD1P28340 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD1P28340 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms