Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPREP23469 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPREP23469 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPREP23469 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPREP23469 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms