Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT1P21579 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT1P21579 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT1P21579 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT1P21579 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT1P21579 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT1P21579 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms