Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYN1P17600 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYN1P17600 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYN1P17600 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYN1P17600 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYN1P17600 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYN1P17600 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYN1P17600 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYN1P17600 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYN1P17600 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYN1P17600 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYN1P17600 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYN1P17600 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYN1P17600 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms