Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD4P09016 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD4P09016 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD4P09016 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD4P09016 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD4P09016 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms