Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top3bQ9Z321 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top3bQ9Z321 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top3bQ9Z321 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top3bQ9Z321 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top3bQ9Z321 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms