Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Crlf3Q9Z2L7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crlf3Q9Z2L7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Crlf3Q9Z2L7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183 ms