Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptgdr2Q9Z2J6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptgdr2Q9Z2J6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ptgdr2Q9Z2J6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptgdr2Q9Z2J6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms