Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd1Q9Z2E2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd1Q9Z2E2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd1Q9Z2E2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mbd1Q9Z2E2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms