Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sfrp4Q9Z1N6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp4Q9Z1N6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp4Q9Z1N6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms