Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hmg20bQ9Z104 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmg20bQ9Z104 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmg20bQ9Z104 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hmg20bQ9Z104 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hmg20bQ9Z104 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hmg20bQ9Z104 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hmg20bQ9Z104 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hmg20bQ9Z104 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hmg20bQ9Z104 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hmg20bQ9Z104 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hmg20bQ9Z104 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hmg20bQ9Z104 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hmg20bQ9Z104 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hmg20bQ9Z104 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms