Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AireQ9Z0E3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AireQ9Z0E3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AireQ9Z0E3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AireQ9Z0E3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AireQ9Z0E3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AireQ9Z0E3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AireQ9Z0E3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AireQ9Z0E3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AireQ9Z0E3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AireQ9Z0E3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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