Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carm1Q9WVG6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carm1Q9WVG6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Carm1Q9WVG6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carm1Q9WVG6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carm1Q9WVG6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms