Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacsin2Q9WVE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pacsin2Q9WVE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pacsin2Q9WVE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pacsin2Q9WVE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin2Q9WVE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms