Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stxbp4Q9WV89 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stxbp4Q9WV89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stxbp4Q9WV89 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stxbp4Q9WV89 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stxbp4Q9WV89 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stxbp4Q9WV89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Stxbp4Q9WV89 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stxbp4Q9WV89 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms