Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ArcQ9WV31 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ArcQ9WV31 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ArcQ9WV31 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ArcQ9WV31 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ArcQ9WV31 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ArcQ9WV31 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ArcQ9WV31 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ArcQ9WV31 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ArcQ9WV31 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ArcQ9WV31 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ArcQ9WV31 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms