Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uchl5Q9WUP7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uchl5Q9WUP7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uchl5Q9WUP7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uchl5Q9WUP7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uchl5Q9WUP7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uchl5Q9WUP7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uchl5Q9WUP7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uchl5Q9WUP7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uchl5Q9WUP7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uchl5Q9WUP7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uchl5Q9WUP7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Uchl5Q9WUP7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uchl5Q9WUP7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uchl5Q9WUP7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms