Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Srd5a3Q9WUP4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srd5a3Q9WUP4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srd5a3Q9WUP4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srd5a3Q9WUP4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms