Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn4Q9WU22 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn4Q9WU22 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn4Q9WU22 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn4Q9WU22 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms