Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn8aQ9WTU3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn8aQ9WTU3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn8aQ9WTU3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn8aQ9WTU3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn8aQ9WTU3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn8aQ9WTU3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn8aQ9WTU3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn8aQ9WTU3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.8 ms