Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpv2Q9WTR1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv2Q9WTR1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv2Q9WTR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv2Q9WTR1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpv2Q9WTR1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv2Q9WTR1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms