Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sept6Q9R1T4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sept6Q9R1T4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sept6Q9R1T4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sept6Q9R1T4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept6Q9R1T4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept6Q9R1T4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept6Q9R1T4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept6Q9R1T4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept6Q9R1T4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sept6Q9R1T4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sept6Q9R1T4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sept6Q9R1T4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms