Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed2Q9R0Q3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed2Q9R0Q3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed2Q9R0Q3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms