Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plod1Q9R0E2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod1Q9R0E2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod1Q9R0E2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod1Q9R0E2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plod1Q9R0E2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms