Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd4Q9QY39 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd4Q9QY39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd4Q9QY39 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzd4Q9QY39 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd4Q9QY39 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzd4Q9QY39 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms