Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc7a8Q9QXW9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc7a8Q9QXW9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc7a8Q9QXW9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc7a8Q9QXW9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms