Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf354bQ9QXT9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf354bQ9QXT9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf354bQ9QXT9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf354bQ9QXT9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf354bQ9QXT9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf354bQ9QXT9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf354bQ9QXT9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf354bQ9QXT9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znf354bQ9QXT9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf354bQ9QXT9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf354bQ9QXT9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf354bQ9QXT9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf354bQ9QXT9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf354bQ9QXT9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf354bQ9QXT9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf354bQ9QXT9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf354bQ9QXT9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf354bQ9QXT9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf354bQ9QXT9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf354bQ9QXT9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Znf354bQ9QXT9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf354bQ9QXT9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms