Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK8

Nmu, Neuromedin-U, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmuQ9QXK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NmuQ9QXK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NmuQ9QXK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NmuQ9QXK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NmuQ9QXK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NmuQ9QXK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NmuQ9QXK8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NmuQ9QXK8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms