Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Phc2Q9QWH1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phc2Q9QWH1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phc2Q9QWH1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phc2Q9QWH1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phc2Q9QWH1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phc2Q9QWH1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phc2Q9QWH1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms